อีวานเกเลียน:3.0+1.01 สามครั้งก่อน เมื่อเนิ่นนานมาแล้ว

เกิดหายนะรุนแรงจากเซคันด์อิมแพกต์ เทวทูตที่สี่โจมตีโตเกียวที่ 3 และชะตากรรมของมนุษยชาติตกอยู่ในมือของเนิร์ฟ องค์กรรัฐบาลพิเศษ ชินจิ อิคาริ เด็กหนุ่มวัย 14 ปีถูกบังคับให้นำอีวา-01 เขากับเรย์ อายานามิ ผู้ขับอีวา-00 ได้รับคำสั่งให้ต่อสู้ แต่อีวา-01 เสียหายหนักเมื่อเทวทูตตนที่หกปรากฏตัว มิซาโตะ คัทสึรางิวางแผนรวบรวมพลังงานไฟฟ้าทั้งหมดของญี่ปุ่นมาไว้ในปืนลำแสงโพซิทรอนเพื่อเอาชนะเทวทูต

มาริ อิลลัสเทรียส-มากินามินำหุ่นรบเฉพาะกาลหมายเลข 05 ออกต่อสู้พิชิตเทวทูตตนที่สาม อาสุกะ แลงลีย์-ชิกินามิและอีวา-02 เอาชนะเทวทูตตนที่เจ็ดได้สำเร็จ เทวทูตตนที่แปดปรากฏตัวและถล่มสำนักงานใหญ่เนิร์ฟ อีวา-03 ถูกเทวทูตตนที่เก้ายึดไปขณะทำการทดสอบและชินจิก็เข้าหยุดยั้ง แต่ก็ได้รู้ว่าอาสุกะอยู่บนหุ่นรบตัวนั้น เก็นโดเปลี่ยนการควบคุมอีวา-01 เป็นระบบดัมมี่และเริ่มการต่อสู้กับอีวา-03

ผ่านไป 14 ปี ชินจิตื่นขึ้นมาบนเรือรบเอเอเอ วุนเดอร์ขององค์กรต่อต้านเนิร์ฟที่ก่อตั้งโดยอดีตสมาชิกของเนิร์ฟ ชินจิได้ยินเสียงของเรย์ดังมาจากอีวามาร์ค 09 ที่ถูกส่งมาช่วยเขา เขาจึงหนีออกจากวุนเดอร์และมุ่งหน้าไปยังเนิร์ฟ คาโวรุ นางิสะพาชินจิไปดูดินแดนที่กลายสภาพ เขาจึงได้รู้ว่าการช่วยชีวิตเรย์ส่งผลให้เกิดเนียร์เธิร์ดอิมแพกต์ที่ทำลายล้างโลกอย่างราบคาบ

กองเรืออาร์คถูกทำลาย และกองกำลังของศัตรูจำนวนมากถูกกวาดล้างเนื่องจากการลงจอดฉุกเฉิน ในขณะที่กองกำลังที่เหลือของ Holy Order of Michael รวบรวมกำลังกันใหม่เพื่อเริ่มการโจมตีครั้งสุดท้ายที่ปราสาท Weiswolf หน่วย wZERO พร้อมด้วยพันธมิตรใหม่ Ashley Ashra เตรียมพร้อมที่จะสกัดกั้นพวกเขา ในขณะเดียวกัน เมื่อ Geass ของเขาหลุดจากการควบคุม Shin ก็เริ่มดำเนินการลบการมีอยู่ของน้องชายของเขาให้สิ้นซาก แต่ Akito ซึ่งสัญญากับ Leila ว่าเขาจะกลับมามีชีวิตอีกครั้ง ปฏิเสธที่จะยอมรับชะตากรรมดังกล่าว และทั้งสองก็ปะทะกันในการต่อสู้ครั้งสุดท้าย

หลังจากพบหน้าศัตรูตัวจริง ซึ่งเป็นคนที่เกี่ยวข้องกับอากิโตะและเป็นผู้รับผิดชอบต่อการสังหารกิอัสที่สั่งสมมา W-0 จึงพยายามเดินทางกลับฐานที่ปราสาทไวส์วูล์ฟ อย่างไรก็ตาม เนื่องจากต้องติดอยู่ที่วอร์ซอเนื่องจากปัญหาเรื่องการระบุตัวตนทางทหาร พวกเขาจึงถูกบังคับให้ยอมรับความช่วยเหลือจากยิปซีในท้องถิ่น ทำให้ทีมมีเวลาสร้างสัมพันธ์ที่แน่นแฟ้นขึ้น ระหว่างนั้น จูเลียส คิงส์ลีย์ ที่ปรึกษาชาวอังกฤษและซูซาคุ คุรุรุกิ ผู้คุ้มกันของเขาเริ่มทำงานร่วมกับอัศวินแห่งเซนต์ไมเคิลเพื่อปราบกองกำลังต่อต้านของยุโรปให้สิ้นซาก โดยใช้อาวุธขนาดยักษ์ที่เรียกว่ากองเรืออาร์คเป็นอาวุธทำลายล้าง

สงครามระหว่างยูโรบริทันเนียและสหภาพยุโรปยังคงดำเนินต่อไป คำสั่งใหม่ถูกมอบให้กับหน่วย W-0 ให้ลงจอดในดินแดนของศัตรูเพื่อเบี่ยงเบนความสนใจ นักบินของหน่วย W-0 ประกอบด้วยผู้บังคับบัญชา เลอิล่า ชาวญี่ปุ่นคนเดียวที่รอดชีวิตจากการต่อสู้ครั้งสุดท้าย อากิโตะ และสามคนที่หลบหนีจากเกตโตทั้งสิบเอ็ดและอาศัยอยู่ในโลกใต้ดิน เรียว ยูกิยะ และอายาโนะ ทุกคนต่างคาดหวังในภารกิจของตน ปฏิบัติการจึงดำเนินต่อไป ในอีกด้านหนึ่งของยูโรบริทันเนีย ชิน ผู้ทำให้ผู้มีพระคุณของเขาฆ่าตัวตายด้วยพลังลึกลับของ "กีอัส" ได้รับการแต่งตั้งให้เป็นผู้นำของอัศวินแห่งเซนต์ไมเคิล ขณะที่ชินค่อยๆ ก้าวหน้าเพื่อความทะเยอทะยานของตัวเอง เขาและผู้ใต้บังคับบัญชาในหน่วยอาชูระก็ได้รับคำสั่งให้ไปประจำการ คนหนึ่งอยู่เพื่อต่อสู้ และอีกคนต่อสู้เพื่อมีชีวิตอยู่

ในขณะที่ W-0 ไม่อยู่ เลอิลาและลูกเรือที่เหลือในฐานพบว่าพวกเขาถูกล้อมรอบโดยอัศวินร้ายแห่งบริตตัน ชิน ฮิวงะซึ่งขับยานเวอร์ซิงเจทอริกซ์ เป็นผู้นำการโจมตีของศัตรู โดยชิงตำแหน่งแกรนด์มาสเตอร์ของอัศวินแห่งเซนต์ไมเคิลมาครอง เมื่อสมาชิกหลักของเธอไม่พร้อม เลอิลาจึงต้องปกป้องเพื่อนร่วมทีมของเธอ แต่เรื่องนี้อาจจะยากกว่าที่เธอคิดมาก เพราะสายลับที่แอบซ่อนอยู่ท่ามกลางพวกเขาในที่สุดก็พร้อมที่จะเปิดเผยตัวตนแล้ว เมื่อไม่มีทางเลือกอื่นนอกจากต้องยอมจำนน เลอิลาจึงนัดพบกับชินเพื่อให้แน่ใจว่าทีมของเธอจะปลอดภัย แต่เมื่อการเจรจาเริ่มล้มเหลว อากิโตะและพันธมิตรที่ไม่คาดคิดก็กลับมาในเวลาที่เหมาะสมเพื่อพลิกสถานการณ์

ผลงานแอนิเมชันญี่ปุ่นจากฝีมือผู้กำกับ Rintaro หรือ Shigeyuki Hayashi ซึ่งได้รับแรงบันดาลใจจากหนังสือมังงะคลาสสิกปี 1949 ของ Osamu Tezuka บอกเล่าเรื่องราวการผจญภัยของยอดนักสืบ Shunsaku Ban และคู่หู Ken-ichi พวกเขาต้องต่อกรกับกลุ่มต่อต้านหุ่นยนต์หัวรุนแรงเพื่อคืนความสงบสุขให้กับเหล่ามนุษย์และหุ่นยนต์ในมหานครเมโทรโปริส

เรื่องราวในในสังคมยูโทเปียที่สร้างขึ้นเมื่อสิ้นสุดสงครามโลกครั้งที่สามนักรบหญิงที่ถูกถอนออกจากพื้นที่เลวร้ายเริ่มเห็นรอยแตกในอาคารใหม่นี้ และชุมชนนี้ได้วางแผนอะไรไว้สำหรับมนุษยชาติที่เหลือ?

Seven years have passed after the battle of Teppelin... Humans have since reclaimed the surface of the earth and enjoy an unprecedented period of peace and prosperity. However, humanity's increasing population growth triggers the sudden emergence of an unknown, powerful enemy. The fearsome, manipulative power of the mysterious Anti-Spiral proves too overwhelming for humans to even fight back. When everyone becomes desperate and loses hope, Team Dai-Gurren members reunite to stand up once again!