"At the end of the century, the greatest battle has begun!"
พวกฟิวเจอร์เรียนซึ่งเป็นนักเดินทางข้ามเวลาจากศตวรรษที่ 23 เดินทางมาถึงญี่ปุ่นเพื่อเตือนพวกเขาถึงความหายนะของประเทศภายใต้ก็อดซิลล่า พวกเขาเสนอที่จะช่วยลบ Godzilla ออกจากประวัติศาสตร์โดยป้องกันไม่ให้การสร้างของเขา เมื่อดูเหมือนก็อตซิลล่าจะหายไป สัตว์ประหลาดตัวใหม่ก็ปรากฏตัวขึ้นพร้อมกับการเปิดเผยความตั้งใจที่แท้จริงของฟิวเจอร์เรียน
佐々木勝彦
Professor Mazaki
โคสุเกะ โทโยฮาระ
Kenichiro Terasawa
中川安奈
Emmy Kano
小高恵美
Miki Saegusa
小林昭二
Yuzo Tsuchiashi
西岡德馬
Takehito Fujio
土屋嘉男
Businessman Yasuaki Shindo
佐原健二
Minister Takayuki Segawa
上田耕一
Former Lagos Island Soldier Ikehata
พวกฟิวเจอร์เรียนซึ่งเป็นนักเดินทางข้ามเวลาจากศตวรรษที่ 23 เดินทางมาถึงญี่ปุ่นเพื่อเตือนพวกเขาถึงความหายนะของประเทศภายใต้ก็อดซิลล่า พวกเขาเสนอที่จะช่วยลบ Godzilla ออกจากประวัติศาสตร์โดยป้องกันไม่ให้การสร้างของเขา เมื่อดูเหมือนก็อตซิลล่าจะหายไป สัตว์ประหลาดตัวใหม่ก็ปรากฏตัวขึ้นพร้อมกับการเปิดเผยความตั้งใจที่แท้จริงของฟิวเจอร์เรียน
Godzilla has become a distant memory for Japan when the destruction of a US submarine raises alarms for Admiral Tachibana. His estranged daughter Yuri investigates the legend of the guardian monsters, who must rise to protect Japan against the vengeful spirits within Godzilla that seek to destroy both the nation and its people for the suffering they inflicted in the Pacific conflict.
เรื่องราวกล่าวถึงการสิ้นสุดของความรุ่งโรจน์ของเหล่ามวลมนุษยชาติในช่วงฤดูร้อนครั้งสุดท้ายของศตวรรษที่ 20 มนุษย์ได้ละทิ้งโลกหลังจากที่เหล่าสัตว์ประหลาดได้ต่อสู้กันเพื่อแย่งชิงความเป็นใหญ่ ซึ่งนั่นทำให้เหล่ามนุษย์ต้องสูญเสียความเป็น ผู้อยู่บนจุดสูงสุดของสิ่งมีชีวิตทั้งปวง ซึ่งราชาที่แท้จริงของโลกนั้นคือ ก็อตซิลล่า อสูรกายขนาดใหญ่ที่ได้สมยานามว่าเป็น ราชาแห่งเหล่าสัตว์ประหลาดทั้งปวง (The King of Monster)
An independent group of researchers called the Godzilla Prediction Network (GPN) actively track Godzilla as he makes landfall in Nemuro. Matters are further complicated when a giant meteor is discovered in the Ibaragi Prefecture. The mysterious rock begins to levitate as it's true intentions for the world and Godzilla are revealed.
สิ่งมีชีวิตลึกลับจากนอกโลกที่มีลักษณะคล้ายก็อตซิลล่าเข้ามาใกล้โลกอย่างรวดเร็ว สัตว์ประหลาดที่มีชื่อว่า SpaceGodzilla ลงจอดเพื่อท้าทายราชาแห่งสัตว์ประหลาด
Inventor Goro Ibuki creates a humanoid robot named Jet Jaguar. It is soon seized by an undersea race of people called the Seatopians. Using Jet Jaguar as a guide, the Seatopians send Megalon as vengeance for the nuclear tests that have devastated their society.
ในปี ค.ศ. 1996 หลังจากการตายของสเปชก็อดซิลลา Miki Saegusa ได้เดินทางไปพบเกาะที่กำเนิดในการตรวจสอบก็อตซิลล่า และลูกชาย แต่เธอก็พบว่าทั้งเกาะถูกทำลายไป ในฮ่องกง ก็อตซิลล่าปรากฏตัว ปกคลุมไปด้วยเรืองแสงมีผื่นขึ้นเหมือนลาวา อาละวาดก่อให้เกิดความเสียหายที่สำคัญและฆ่าพลเรือนหลายพันคน กลุ่มของผู้แทนจากกองกำลังป้องกันตนเองญี่ปุ่น ว่าจ้างนักศึกษาวิทยาลัย Kenichi Yamane หลานชายของ Dr. Kyohei Yamane เข้ามาทำงานที่ศูนย์ในความพยายามที่จะคลี่คลายความลึกลับของสภาวะของก็อตซิลล่า Yamane สงสัยว่า หัวใจของก็อตซิลล่า ทำหน้าที่เป็นเครื่องปฏิกรณ์นิวเคลียร์ ที่ผ่านการหลอมละลายนิวเคลียร์ เมื่อก็อตซิลล่ามีอุณหภูมิถึง 1,200 องศาเซลเซียส เขาจะระเบิดด้วยความเร็วเพิ่มมากขึ้นกว่าทุกอาวุธนิวเคลียร์ของโลก การปรับใช้ต่อสู้ของยานพาหนะ JSDF ที่บินติดอาวุธด้วยอาวุธเย็นต่อต้านนิวเคลียร์ในการป้องกันครั้งนี้คือ Super X ในขณะที่นักวิทยาศาสตร์สร้างสูตรใหม่สำหรับการ Oxygen Destroyer ที่ถูกสร้างขึ้นโดย Dr. Serizawa ในปี ค.ศ. 1954
Mothra and her fairies return to Japan to warn mankind that they must return Kiryu to the sea, for the dead must not be disturbed. However Godzilla has survived to menace Japan leaving Kiryu as the nation's only defense.
ถึงแม้ว่าบริบทของการเล่าเรื่องตัวละครจะเปลี่ยนไป และก็อตซิลล่าถูกลดบทบาทลงมากเท่าไร แต่อย่างหนึ่งที่ Godzilla: The Planet Eater ยังคงเคารพต้นฉบับหนังก็อตซิลล่ายุคโชวะเมื่อ 65ปีก่อน ที่ไม่ได้วางตัวราชาสัตว์ประหลาดในฐานะ ต้นกำเนิดของหายนะ แต่เป็นสัญลักษณ์ที่คอยย้ำเตือนถึงความสูญเสียอันโหดร้ายที่เป็นผลมาจากการทำสงครามแย่งชิงอำนาจเพื่อความเป็นที่หนึ่งของมนุษย์ ตั้งแต่ยุคสงครามโลกครั้งที่ 2 ต่อเนื่องไปจนอนาคตที่ไม่มีจุดจบ
อากาเนะ นักบินของกองกำลังป้องกันตนเองของญี่ปุ่น ต้องเผชิญกับชะตากรรมอันเลวร้าย เมื่อก็อตซิลล่าตัวใหม่ปรากฏตัวขึ้นที่ทาเทยามะ เพื่อตอบโต้ ไซบอร์กชื่อคิริวจึงถูกสร้างขึ้นจากซากของก็อตซิลล่าตัวเดิม ไซบอร์กตัวดังกล่าวถูกค้นพบว่าเป็นแหล่งกักเก็บวิญญาณที่กระสับกระส่ายของก็อตซิลล่าตัวเดิม ขณะที่อากาเนะต้องเรียนรู้ที่จะค้นหาคุณค่าในชีวิตของเธอเองเช่นกัน
นักบินอวกาศ Glenn และ Fuji สำรวจดาวเคราะห์ X และเผชิญหน้ากับเอเลี่ยนลึกลับที่รู้จักกันในชื่อ Xiliens ซึ่งขอให้ผู้คนบนโลกช่วยกอบกู้โลกของพวกเขาจาก "Monster Zero" เพื่อแลกกับการยืม Godzilla และ Rodan พวก Xiliens จึงเสนอวิธีรักษาโรคมะเร็ง ขณะที่เกล็นน์สืบสวน เขาได้เริ่มมีความรักกับมิสนามิคาวะ และได้ค้นพบความตั้งใจที่แท้จริงของซีเหลียน