เคโรโระ ขบวนการอ๊บอ๊บป่วนโลก เดอะมูฟวี่ 2 องค์หญิงแห่งท้องทะเลลึก

Nobita and his friends find a portal to a mysterious resort filled with metal buildings. They soon discover that the person who opened the portal for them has an ulterior motive.

เกิดอุบัติเหตุในการเดินทางย้อนอดีตไปเกาะมหัศจรรย์จึงเป็นเหตุให้พ่อของโนบิตะย้อนเวลามาในสมัยเป็นเด็ก ๆ รุ่นราวคราวเดียวกันกับโนบิตะ ทั้ง 2 คนพบกัน แต่พ่อของโนบิตะจำอะไรไม่ได้เพราะโดนของวิเศษของโดราเอมอนทำให้ลืมความทรงจำ การผจญภัยในเกาะมหัศจรรย์ และปริศนาด้วงทองคำจึงเริ่มต้นขึ้น และเหตุการณ์ในครั้งนี้ของวิเศษของโดราเอมอนแทบทุกชิ้นอยู่ในการซ่อมบำรุง การผจญภัยในเกาะจึงมีของวิเศษเหลืออยู่ไม่กี่ชิ้นเท่านั้น และแน่นอนว่ามีศัตรูที่หมายปองพลังเหล่านั้นกำลังปรากฏอยู่ด้วย จนนำไปสู่การต่อสู้บทใหม่ที่พิสูจน์มิตรภาพของพวกเขา

โรพอลเป็นเด็กชายคนหนึ่งในอวกาศที่ห่างไกลจากโลกมาก วันหนึ่งขณะที่ทำการวาร์ปก็เกิดอุบัติเหตุขึ้นจนยานอวกาศเสียหาย โรพอลจึงกลับบ้านไม่ได้เมื่อตกดึก "จามี่" สัตว์เลี้ยงและคู่หูของโรพอลก็คิดจะออกไปหาเสบียง จึงเปิดประตูห้องเก็บของในยานที่ได้ไปเชื่อมต่อเข้ากับเสื่อใต้ที่นอนของโนบิตะโดยบังเอิญ ทำให้ได้พบกับโนบิตะและโดราเอมอน เมื่อรู้เรื่องราวทั้งหมดโดราเอมอนจึงช่วยซ่อมยานอวกาศให้ โรพอลและจามี่จึงเดินทางกลับดาวโคยะโคยะบ้านเกิดของพวกเขาได้ แต่บนดาวโคยะโคยะนั้นมีเหล่าร้ายผู้หมายยึดครองแร่ธาตุของดาวดวงนี้อยู่ โนบิตะและเพื่อนๆ จึงต้องหาทางปกป้องดาวดวงนี้ไว้ให้ได้

อยู่มาวันหนึ่ง โนบิตะได้พบเจอกับ ยานอวกาศขนาดเล็กเข้าโดยบังเอิญ และภายในยานนั้น ได้เจอกับมนุษย์ต่างดาวขนาดจิ๋วชื่อว่า ปาปิ ซึ่งได้หลบหนีกองทัพ PCIA มาจากดาวพิริกาของเขา โดราเอมอนและผองเพื่อนจึงใช้ ไฟฉายย่อส่วน เพื่อให้มีขนาดเท่ากับปาปิ และสร้างมิตรภาพระหว่างเพื่อนกับปาปิได้ แต่แล้วเมื่อมียานอวกาศรูปปลาวาฬไล่ตามปาปิ มายังโลกเพื่อมาจับตัวปาปิ และยังโจมตี โดราเอมอนและเพื่อนๆ ปาปิจึงโทษตัวเองว่าเป็นต้นเหตุของเรื่อง ปาปิจึงลุกขึ้นต่อสู้กับกองทัพ PCIA ด้วยตัวเอง เพื่อปกป้องดาวพิริกา และช่วยเหลือปาปิ โดราเอมอนและเพื่อนๆ จึงรวมพลังเพื่อช่วยเหลือปาปิ สหายตัวจิ๋วของพวกเขาจากเงื้อมมือของกองทัพ PCIA ที่เข้ามารุกราน

วันหนึ่งโนบิตะไปเก็บเอาต้นไม้เล็ก ๆ จากภูเขาหลังโรงเรียน และใช้ยาวิเศษของโดราเอมอนทำให้ต้นไม้นั้นเคลื่อนไหว และพูดเองได้เหมือนมนุษย์ โนบิตะตั้งชื่อให้ว่า "คีโบ" อีกด้านหนึ่งมนุษย์ต่างดาวพืชได้วางแผนจะทำลายล้างมนุษย์โลกเพื่อช่วยเหลือเหล่าพืชบนโลกโดยจับตัวคีโบไปเพื่อใช้ปลุกมนุษย์ยักษ์สีเขียวในตำนานขึ้นมา พวกโนบิตะจึงต้องบุกไปยังดาวมนุษย์พืชเพื่อช่วยเหลือตัวคีโบ

โนบิตะและชิซุกะถ่ายหนังแล้วไปพบกับมนุษย์ต่างดาวตัวจิ๋ว

วันหนึ่งที่โดราเอมอนได้ถูกขโมยกระดิ่งห้อยคอไปโดย “จอมโจรดีลักซ์” ขณะนอนหลับ ทำให้กลายเป็นหุ่นยนต์แมวเพี้ยน ๆ ที่ใช้งานได้ไม่เต็มประสิทธิภาพไปเสียอย่างนั้น โนบิตะที่กำลังเห่อเรื่องลี้ลับอยู่จึงได้ใช้อุปกรณ์วิเศษ “เชอร์ล็อกโฮล์มส์เซ็ต” ที่แม้ว่าจะเป็นของเล่นสืบหาของหายเล็ก ๆ น้อย ๆ แต่ได้ชักนำให้โนบิตะทำตัวเป็นนักสืบ และเบาะแสทั้งหมดก็พาทุกคนไปสู่พิพิธภัณฑ์ของวิเศษแห่งโลกอนาคต ที่รวบรวมของวิเศษทุกชิ้นที่เคยมีมาในโลกนี้ แต่แล้วความสนุกเพลิดเพลินก็ไม่ได้หยุดอยู่แค่ตรงนี้ เมื่อจอมโจรดีลักซ์ผู้ที่ขโมยกระดิ่งของโดราเอมอนไปก็ปรากฏตัวขึ้น และหมายตาของวิเศษในพิพิธภัณฑ์แห่งนี้อีกเช่นกัน เป้าหมายของจอมโจรดีลักซ์คืออะไร และโนบิตะกับผองเพื่อนจะตามหากระดิ่งของโดราเอมอนเจอได้อย่างไร การผจญภัยในแดนมหัศจรรย์ที่ไม่เคยมีมาก่อนในโดราเอมอนเดอะมูฟวี่กำลังรอทุกคนเข้าไปค้นหาความลับในพิพิธภัณฑ์แห่งนี้กันอยู่

สุนัขจรจัดลึกลับตัวหนึ่งที่พลัดหลงรอนแรมหลายประเทศมาจนถึงญี่ปุ่น จนได้มาพบกับโนบิตะผู้ซึ่งพยายามรับดูแลเจ้าสุนัขตัวนี้ไว้ด้วยความสงสาร ในขณะเดียวกันไจแอนท์ก็ได้พบกับภาพหลอนของเทพเจ้าที่อยู่ในต่างแดน ซึ่งผลักดันให้ทุก ๆ คนอยากจะออกผจญภัยสู่ดินแดนป่าลึกในแอฟริกาเพื่อค้นหาคำตอบของเรื่องราวทั้งหลาย ภาพหลอนที่ทุกคนได้เห็นมีส่วนเกี่ยวข้องกับสุนัขปริศนาตัวนี้หรือไม่ พวกเขาไม่รู้ว่าปลายทางที่รอพวกเขาอยู่นั้น คืออาณาจักรลี้ลับอันสุดแสนอันตรายและเต็มไปด้วยความวุ่นวายที่รอวีรบุรุษมากอบกู้อยู่

หมอผี "ยูรันดา" แห่งเผ่าสลาตัน ผู้ครอบครองลมใช้เวทมนต์ปลุกชีพปีศาจร้ายให้ออกอาละวาด แต่ในที่สุดปีศาลก็ถูกปราบโดยผู้นำแห่งเผ่าสายลมจนกลายเป็นไข่ 3 ฟอง วันหนึ่งซูเนะโอะสะดุดไข่ประหลาดฟองหนึ่ง จึงเขวี้ยงจนแตกออกเป็นพายุหมุนเล็ก ๆ ซูเนะโอะขับไล่มันออกไป โนบิตะมาพบเข้าและตั้งชื่อให้ว่า "ฟูโกะ" โนบิตะรักมันมาก จนกระทั่งวันหนึ่งพวกเขาทั้งหมดหลงเข้าไปในดินแดนลึกลับที่ใช้ลมในการดำเนินชีวิตและได้รู้ว่า ฟูโกะเป็นส่วนหนึ่งของไข่จอมปีศาจ หากทั้งหมดมารวมตัวกันปีศาจร้ายจะฟื้นคืนชีพ โนบิตะและเหล่าผองเพื่อนจึงต้องใช้ของวิเศษของโดราเอมอนเพื่อปกป้องโลกจากเหล่าร้ายอีกครั้ง

ระหว่างที่กำลังเดินทางไปยังเมือง โรชาน ซาโตชิและเพื่อนๆ ได้พบกับโปเกมอนประหลาด เคลดิโอ ซึ่งกำลังถูกโปเกมอนในตำนาน คิวเร็ม ตามล่าอยู่พวกเขาได้ยื่นมือเข้าช่วยเหลือเคลดิโอ และเข้าไปพัวพันกับการต่อสู้ของเหล่านักรบศักดิ์สิทธิ์โดยไม่รู้ตัว ซาโตชิจะช่วยเคลดิโอและเหล่านักรบศักดิ์สิทธิ์โดยไม่รู้ตัว ซาโตชิจะช่วยเคลดิโอและเหล้านักรบศักดิ์สิทธิ์จากความโกรธกริ้วของ คิวเร็ม ได้หรือไม่ ?