"ลิโกะ" เทรนเนอร์มือใหม่จากภูมิภาคพัลเดีย ได้เข้าเรียนที่สถาบันอินดิโกในคันโต ซึ่งเธอได้เลือกเนียวฮะมาเป็นคู่หู ไม่ทันไร!! ลิโกะ ก็ถูกทีมเอกซ์พลอเรอร์ (Explorers) แย่งจี้ห้อยคอที่เธอได้รับจากคุณยายของเธอไป แต่ก็ได้รับการช่วยเหลือจากกลุ่ม Rising Volt Tacklers ทำให้ลิโกะได้ร่วมผจญภัยไปกับพวกเขา ระหว่างแวะพักบนเกาะแห่งหนึ่งในคันโต กลุ่ม Rising Volt Tacklers ได้พบกับเด็กชายที่ชื่อ รอย ซึ่งเขาก็มีโฮเกเตอร์ที่ได้เดินทางมาด้วยกันเป็นคู่หู นอกจากนี้ รอยยังได้เข้าร่วมทีม Rising Volt Tacklers เพื่อค้นหาโปเกมอนในตำนาน อย่างเรย์ควาซา ที่ออกมาจากโปเกบอลโบราณของเขา ที่เขาได้รับจากปู่ รวมถึงสำรวจโลกอันแสนกว้างใหญ่นี้อีกด้วย ในระหว่างการผจญภัย ลิโกะและรอย ได้เรียนรู้หลายอย่าง เช่น วิธีใช้ไอเท็ม มิตรภาพของพวกพ้อง และตนเอง ทั้งนี้เพื่อมุ่งไปสู่การเป็นโปเกมอนเทรนเนอร์นั้นเอง
